V svetu Padavine , puščave so skoraj popolnoma preplavljene z mutiranimi grozotami, ki si ne bi mislile, da bi vam naredile naslednji obrok. Eno najbolj zloglasnih teh bitij so Super Mutanti. Te velikanske zelene pošasti so bili nekoč ljudje; zdaj so mutirali v nasilna, Hulku podobna bitja.
Za razliko od večine drugih puščavskih bitij Super Mutanti niso bili posledica jedrskih padavin bomb. Med vojno med ZDA in Kitajsko pred apokalipso leta 2077 so bile številne veje vlade in nekatere zasebne korporacije zadolžene za razvoj prebojev, da bi dosegle prednost pred sovražnikom. Eden od projektov je bil prisilni evolucijski virus, umetno ustvarjen virus podjetja West Tek, ki je bil prvotno namenjen zaščiti pred različnimi oblikami biološke vojne. Ko se je izkazal njegov resnični potencial, se je projekt preselil v vojaško bazo Mariposa na Srednjem zahodu v upanju, da bo ustvaril vrhunske super vojake.
Ljudje, na katerih je bil preizkušen FEV, so pokazali vrhunsko fizično moč, odpornost na škodo, staranje, bolezni in visoko stopnjo sevanja. Vendar so ti mutanti pogosto postali veliko manj inteligentni in izjemno nasilni do kogar koli in do česar koli, kar ni bil eden izmed njih. Poleg tega so njihove transformacije povzročile izgubo vseh njihovih reproduktivnih organov, zaradi česar so postali brez spola in sterilni. To pomeni, da se Super Mutanti ne morejo razmnoževati naravno, in edini način, da zaslužijo več, je preoblikovanje več ljudi, ki uporabljajo virus.
Preden so znanstveniki v Mariposi zaključili svoje raziskave, je lokalni garnizon, ki ga je vodil kapitan Roger Maxon, odkril resnico o njihovem delu in izvedel, da bodo vojne ujetnike podvrgli FEV. Zgroženi so se uprli in usmrtili raziskovalno osebje, zapečatili FEV, preden so se na koncu odpravili do bunkerja Lost Hills, da bi oblikovali Bratstvo jekla . Do dogodkov, ki so privedli do nastanka prve prave vojske Super Mutantov, bi baza ležala zapuščena desetletja.
Leta 2102 sta odpravo v Mariposo vodila trgovec v vozliščih po imenu Harold in nekdanji prebivalec trezorja po imenu Richard Gray. Ko so vlomili, jih je napadlo avtomatizirano varovanje baze, pa tudi nekateri preživeli mutirani. Vsi člani ekipe so bili ubiti, razen Harolda, ki je bil ranjen, a mu je uspelo pobegniti, in Greya, ki je po nesreči trčil v enega od kadov FEV. Zaradi njegove dolgotrajne izpostavljenosti virusu je postal grozno mutirana masa mesa, vendar z močno povečano inteligenco, prerojen kot Gospodar. Nadaljnje mutacije so mu omogočile nevronsko povezavo z računalniki, kar mu je omogočilo dostop do zbirk podatkov baze.
Z eksperimentiranjem mu je uspelo ustvariti nove Super Mutante, od katerih so nekateri še vedno ohranili svojo inteligenco. Ker je verjel, da so ti mutanti edini, ki so lahko kdaj preživeli v puščavi, si je začel prizadevati za izgradnjo vojske z ugrabitvijo človeških naseljencev in njihovo preoblikovanjem, pri čemer je uporabil kult človeških privržencev doomsdaya kot fronto. Vendar so bila ta prizadevanja onemogočena s pravočasnim posredovanjem prebivalca trezorja in bratovščine, ki sta vodila napad na njihovo bazo Mariposa in jo uničila ter ubila Mojstra.
Ko je mojster mrtev in večino njegove vojske lovila bratovščina, so Super Mutanti pobegnili v puščavo, da bi si skušali zgraditi nova življenja. Eden takih prizadevanj je naredil inteligentni mutant Marcus in presenetljivo bratstvo Paladin po imenu Jacob. Kljub temu da so bili sovražniki, so kmalu postali veliki prijatelji in ustanovili Broken Hills kot zatočišče za ljudi, ghoule in mutante, da živijo v harmoniji. Izbranca je Marcusa kasneje zaposlil, da bi se pridružil njegovemu prizadevanju, da reši svoje pleme in preostalo puščavo pred enklavo.
Ko se je leta 2241 ponovno pojavila enklava, so skušali uporabiti FEV za pomoč pri globalnem genocidu, tako da so ga spremenili, da bi ubil kar koli z mutirano DNA. Z ujetimi priseljenci NCR, ki so bili prisiljeni v suženjstvo, so izkopali ruševine Mariposa, da bi našli preostale kadi s FEV. Njihova testiranja so privedla tudi do preobrazbe vojaka iz enklave po imenu Frank Horrigan v močnega hibrida Super Mutant. Preden so lahko spremenili sev, je izbrani vdrl v njihov sedež in uničil bazo skupaj z zalogami.
Potem, ko na zahodu ni bilo več FEV, so Super Mutanti postajali vse redkejši. Kljub prizadevanjem za vključitev v človeške skupnosti so bili mnogi še vedno nezaupljivi ali ksenofobični do mutantov. V Mojaveju je bil ustanovljen Jacobstown, ki mutantom zagotavlja varnost in zdravljenje tistim, ki še vedno trpijo zaradi psihoze in agresije.
Medtem ko je bilo Mariposa glavno raziskovalno središče za FEV, ni bilo edino mesto v državi, ki je vsebovalo zloglasni virus. Na lokacijah, kot so Capital Wasteland, Commonwealth in Appalachia, so imeli znanstveniki lastne zaloge FEV, s katerimi so eksperimentirali na različnih temah. Ti Super Mutanti so bili večinoma enaki kot njihovi kolegi z Zahodne obale, le da so najstarejši še naprej rasli in postali močni behemoti. Prav tako niso imeli jasne vodstvene strukture in so bili veliko manj organizirani, predvsem zaradi inteligentnih mutantov, ki so bili veliko redkejši. Kljub temu so bili v svojih regijah še vedno velika grožnja.
Mutanti kapitalskih puščav izvirajo iz Trezor 88 , ki so svoje prebivalce eksperimentirali s FEV. Lokalno poglavje Bratovščine je vodilo 20 let dolgo vojno, da jih je omejilo, preden so končno izvedeli, od kod izvirajo, in uničili Trezor leta 2277. V tem času se je ponovno pojavila tudi Enklava, ki je želela nadaljevati svoje načrte ubijanja vsega mutiranega. Na srečo sta Lone Wanderer in Bratstvo ustavila njegova prizadevanja, hkrati pa uničila tudi zadnji znani vzorec spremenjenega FEV.
V Commonwealtha je Inštitut nekako imel lastno oskrbo s FEV in si začel prizadevati za ustvarjanje nove pasme mutantov, ki bi delovali kot delavci in vojaki na površju. Medtem ko so se raziskovalci kasneje osredotočili na razvoj naprednih sintetizatorjev za te vloge, je Inštitut še naprej ugrabljal naseljence in jih preoblikoval v mutante, preden jih je spustil v naravo. Nikoli ni razloženo, zakaj, a mnogi domnevajo, da je Inštitut to storil, da bi frakcije Commonwealtha ohranile ločenost in se ne bi mogle organizirati dovolj, da bi jih izzvale.
Na splošno velja, da za tiste, ki so se preoblikovali v super mutante, ni zdravila; vendar je bila ta teorija razkrinkana z delovanjem dr. Briana Virgilija. Vergil, nekdanji raziskovalec na Inštitutu, se je spremenil v Supermutanta in pobegnil v izgnanstvo v Žareče morje. Leta 2287 je Virgil ustvaril serum, ki je mutacijo uspešno vrnil in ga obnovil v človeški obliki. Vendar je bilo zdravilo prilagojeno specifičnemu sevu FEV, s katerim se je okužil, in posploševanje formule za zdravljenje drugih lahko traja desetletja.
Kljub svoji zloglasnosti po puščavi je bilo nekaj mutantov, ki so se dvignili nad svojo agresijo in si prizadevali delati dobro. Nekateri mutanti, kot so Marcus, Fawkes in Strong, so skozi zgodovino celo postali zvesti in močni zavezniki legendarnim puščavskim junakom.
